Cell | 免疫疾病中免疫细胞特异基因调控一个系统全景图

明治大学的数据集比对其他部门和RIKEN Research数据集比对所的同事们并未曾建立了首个针对自身自体性性疾病和自身瘙痒性性疾病的蛋白质数据集库。期望这一人力能为自体性疾病的演进提供一新见解，并不太可能有助于类固醇的注意到。科学家们还期望，与自体持续性的蛋白质数据集著者事与愿违不太可能应用诸如COVID-19等传染病的数据集比对。

明治大学工程项目数据集比对助理，针灸风湿病学家，新功能蛋白质学专家Mineto OtaClark却说：“要了解性疾病，就必须深刻理解蛋白质相异的新功能。有了这个数据集集，我们就可以将与性疾病持续性的DNA脱氧核糖核酸转变的数据集与对性疾病胃癌机制并不关键的蛋白质和细胞会子类紧密联系大大的。”Ota是该团队发表在《Cell》杂志上的篇名的主要笔记，篇名结尾为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该工程项目是与Chugai Pharmaceutical的科学家们合作伙伴顺利进行的。

笔记说道，自体细胞内的性疾病（IMD）之外从自身自体性到自身瘙痒的多种病理。他们引述，尽管IMD当中炎性细胞会因子的异常活动表明自体细胞会新功能发生了转变，但是，“对于IMD的持续性蛋白质甚至持续性细胞会子类知之甚少。”

全蛋白质相似性数据集比对（GWAS）注意到了许多与IMD持续性的蛋白质位点。但是，在此类相似性数据集比对当中鉴定成的许多蛋白质相异都位于调节蛋白质“on”或“off”表达出来的DNA非字节区域，而不是位于蛋白质字节脱氧核糖核酸当中。数据集比对小组引述：“GWAS并未曾洞察了许多与多样等位基因和性疾病持续性的蛋白质位点，之外IMD。这些相异当中的大多数都位于非字节蛋白质区域，尤其是催化反应元件，如增强子和内含子。”

为了洞察催化反应DNA的新功能，一种相异子类的蛋白质比对，称为表达出来定量等位基因蛋白质位点（eQTL），旨在将DNA脱氧核糖核酸的相似之处与表征的相似之处紧密联系大大的。利用eQTL数据集，数据集比对其他部门可以对催化反应DNA脱氧核糖核酸的目的、催化反应脱氧核糖核酸当中的相异如何影响其催化反应蛋白质的表达出来以及这些表征相似之处如何导致性疾病做成更理应的猜测。

其它针对自体的eQTL数据集比对并未曾在顺利进行当中，但先前的数据集比对工作只之外身体健康义工，并检查了局限数量的细胞会子类。数据集比对其他部门说道：“对身体健康供体自体细胞会的数据集比对不太可能未曾能捕获性疾病稳定状态下注意到的一系列eQTL波动。此外，虽然对自体细胞会的新颖刺激可以在某种程度上演示性疾病稳定状态，但并不也许再现成体外的生理环境。”

Ota足量道：“瘙痒稳定状态下，自体细胞会的物理化学特性与身体健康稳定状态下的有所不同细胞会截然相异。与自体状况持续性的蛋白质相异不太可能只在体弱稳定状态下起起到，因此对于这种子类的蛋白质数据集比对，从单纯病患者额头提供样本并不关键。”

在他们简介引述的数据集比对当中，数据集比对小组对79名身体健康义工和337名被诊疗患有10种相异子类自体细胞内性疾病（之外类风湿性关节炎、持续性红斑狼疮和持续性硬化症）的病患者顺利进行了全蛋白质高通量。所有义工都是日本人裔。

了解自体细胞内的性疾病有着娱乐性，因为尽管每种性疾病在针灸上都是相异的，但仍有许多分开之处，并且有着有所不同诊疗的病患者不太可能会表现成并不相异的症状。数据集比对其他部门足量却说：“由于所有这些自然环境，一次学习一种自体细胞内性疾病的能力也是局限的。但是，如果我们两人数据集比对10种性疾病，就可以更全盘地了解这些子类的性疾病。”

在完成全蛋白质高通量后，数据集比对其他部门从义工的血液样本当中辨认成28种相异子类的自体持续性细胞会，并精准测量了这些细胞会当中的表征。“我们在著者当中认成，每种自体细胞会子类都有相异的eQTL结果，这可以告诉我们细胞会子类间蛋白质催化反应的相似之处，以及哪种细胞会子类对于演进哪种性疾病至关关键。”数据集比对其他部门却说。

笔记报告却说，“在表征比对当中，我们在一个平台上对多个IMD顺利进行比较，使我们能够描述每个性疾病（病患者）的不同之处，并比对与单个性疾病甲基化持续性的蛋白质，以及在都由IMD当中失调的通路……我们的数据集集使我们能够测定每个特定细胞会子类当中eQTL波动的生理（性疾病）剧中驱动的分心。”

数据集比对其他部门将取得的人力定名为明治大学自体细胞会表征著者（ImmuNexUT），并却说它代表人了使用东亚裔义工建立的仅次于的eQTL数据集集。他们阐述道：“我们确定了自体细胞会子类甲基化的eQTL波动，之外过去未曾引述的有名细胞会子类，它们在生理瘙痒必需下的自然环境，以及这些eQTL与IMD遗传间的值得注意相似性。”

“到目前为止，在这一领域，大规模的蛋白质和新功能蛋白质数据集比对主要是利用东欧理应顺利进行的，尽管群体自然环境对于精准理解蛋白质新功能至关关键。”数据集比对其他部门却说，“这个日本人病人的eQTL著者对于抛开这种以东欧为当的中心的偏见，混合东欧的数据集集进一步数据集比对DNA相异的新功能，也有着关键意义。”

数据集比对其他部门期望ImmuNexUT数据集库将继续增长，并事与愿违为病患者带来能够的结果。他们却说：“与之前引述的人力相比，我们的数据集集有着独特而有利的特点，之外全盘的自体细胞会细分、理应间自体状况的转变以及理论上的非东欧理应。”